Die Fakultät besteht aus den Abteilungen für Geschichtswissenschaft, Philosophie und Theologie. Zu der 1973 gegründeten Fakultät für Geschichtswissenschaft kamen in den Jahren 1980 die Abteilung Philosophie (seit 1971) und 2002 die Abteilung Theologie (seit 1980) hinzu. Obwohl nicht als gemeinsame Fakultät gegründet, war doch der Etablierung aller drei Fächer an der jungen Reformuniversität Bielefeld das Vorhaben gemeinsam, ihre jeweilige Disziplin neu auszurichten. Das gilt für die Theorieorientierung und den epochenübergreifenden Austausch der Geschichtswissenschaft ebenso wie für den analytischen und wissenschaftstheoretischen Zuschnitt der Philosophie und die interdisziplinäre Forschung der Theologie.