Католический университет Айхштетт-Ингольштадта привержен своим двойным историческим корням: с одной стороны, он возник из Епископального философского богословского колледжа (с 1924 года), который, в свою очередь, вернулся в Коллегию Виллибальдина, основанную в 1564 году, которая существовала до 1807 года и была перестроена в 1843 году как лицей. Другой исторический корень - Университет образования Эйхштетта, основанный в 1958 году по решению баварских епископов. В 1972 году два церковных университета в Eichstätt и недавно созданные курсы технического колледжа были объединены в единый университет. В 1980 году он стал католическим университетом Eichstätt, а в 2001 году его название было расширено до Ингольштадта. Ингольштадт также вспоминает давнюю традицию: в 1472 году там был основан Ингольштадтский университет с папским одобрением как первый баварский университет.

Под защитой церкви и государства, университеты были созданы в 12 и 13 веках; Папы и императоры предоставили этим сообществам привилегии для обучения, преподавания и исследований. Сотрудничество между государством и церковью в Баварии позволяет существовать сегодня католическому университету - единственному в немецкоязычном пространстве.

Тогдашний председатель епископской конференции во Фрайзинге Джозеф Кардинал Ратцингер писал о преобразовании всего университета в католический университет: «Я желаю, чтобы Католический университет Эйхштетта мог эффективно претворить в жизнь эти духовные истоки нашей культуры в образовательной среде настоящего и до настоящего времени за пределами круга учителей и учеников, работающих над ним, это было в целом плодотворно, что срочно требовалось таким силам в кризисной ситуации».

Католический университет разделяет это желание сегодня и в будущем. Это его постоянное стремление к подходу и реализации идеи католического университета со всей серьезностью и решительностью. Претензии и обязательства, вытекающие из термина «католический университет», состоят в том, что они открыты для знаний в целом и расширяют кругозор в целом. «Из-за определенного вида универсального гуманизма Католический университет полностью посвящен изучению всех аспектов истины в его существенной связи с высшей истиной, которая есть Бог». Этот мандат бросает вызов и обязывает всех тех, кто находится активным в Католическом Университете.

Девиз Святой Екатерины Александрийской, покровительницы университета, который - «Promissa Nec Aspera Curans», «заботясь об обещаниях, а не о земных невзгодах» - был полезным и руководящим принципом - оставалась верной своим убеждениям. «В случае необходимости католический университет должен иметь смелость высказывать неудобные истины, которые могут не понравиться общественному мнению, но которые необходимы для защиты истинного блага общества».

Согласно основополагающей конституции, «ответственность за выполнение своего мандата и укрепление католического характера (...) в первую очередь лежит на самом университете».